為確保農林工程甲級監理公司的安全管理工作得到充分保障，公司需要建立和完善安全管理制度。以下是可能包括在該制度中的關鍵要素：

1. 安全管理目標和原則：明確公司安全管理的整體目標和基本原則，如人身安全第一、預防為主、綜合管理等。

2. 安全責任分工：明確安全管理的責任與義務，并將其分解到各個職能部門和崗位，確保每個人都有明確的安全職責。

3. 安全管理組織架構：建立清晰的安全管理組織架構，包括安全領導人、安全管理部門等，確保安全管理的落實和執行。

4. 安全宣傳教育：制定安全教育和培訓計劃，包括新員工入職安全教育、定期培訓、應急演練等，提高員工的安全意識和應對能力。

5. 安全規章制度：制定和修改必要的安全規章制度，明確各項安全管理要求和操作流程，保證安全規范和標準的執行。

6. 安全檢查和評估：建立定期的安全檢查和評估機制，包括定期巡查、安全隱患排查、風險評估等，及時發現并解決安全隱患。

7. 安全記錄和報告：要求施工現場安全情況和事故發生情況的記錄和報告，包括事故報告、事故調查分析、安全巡查記錄等。

8. 應急預案和處置：制定完善的應急預案和處置方案，包括事故報警流程、應急電話、緊急救援機制等，確保事故應急處理的迅速和有效。

9. 安全獎懲制度：建立獎懲制度，對積極參與安全管理和工作的人員給予獎勵，對違反安全規定和產生事故的責任人進行追責和懲罰。

10. 安全管理持續改進：定期評估和改進安全管理制度的有效性，通過學習和吸取經驗教訓，不斷提升安全管理水平。

這些要素將構成農林工程甲級監理公司的安全管理制度框架，幫助實現全面、科學、有效的安全管理，確保施工現場的安全生產和人員的安全。公司應嚴格執行制度，并根據實際情況進行適時的修訂和完善。